Vu, Trung Nghia – Clonal heterogeneity and drug sensitivity of Acute Myeloid Leukemia

Bakgrund

Akut myeloid leukemi (AML) är en aggressiv blodcancer som är mycket genetiskt komplex och celldiversifierad. Heterogeniteten i både tumörgenetiska förändringar och cellulära subtyper gör att respons på behandling är mycket svår att förutspå. Responsen är en avgörande del i individanpassad cancerbehandling. Medan sambandet mellan läkemedelskänslighet och genetiska förändringar till stor del har utretts på vävnadsnivå, är studier på encellsnivå, såsom cellulär heterogenitet, fortfarande begränsade. Vi ska undersöka hur respons på cancerbehandling påverkas av cellers heterogenitet i AML-patienter.

Beskrivning

Vi ska utvärdera hur läkemedelskänslighet är associerad med cellers heterogenitet i AML-tumörer som upptäckts från encellsdata. Vi ska undersöka mångfalden av förändringar genom att integrera flera biologiska egenskaper inklusive mutationer, immuncellstyp, RNA-uttryck och alternativa delningsmönster. Vi ska använda den utökade informationen, andra biologiskt betydelsefulla egenskaper från omik-data på vävnadsnivå och avancerade maskininlärningsmetoder för att förbättra prognos av respons på individuella cancerläkemedel och läkemedelskombinationer för patienter med AML samt utforska cancerframkallande mekanismer för cancerläkemedel.

Mål

Att ta fram kunskaper om sambandet mellan läkemedelskänslighet och cellers heterogenitet i AML-tumörer. Att ta fram förbättrade prediktionsmodeller av läkemedelsrespons för patienter med AML.